El Municipio de Mocoa, cuenta con 5 cuencas importantes de donde se desprenden microcuencas como La Taruca, Taruquita y Sangoyaco. El municipio presenta un grave problema ambiental radicado en la contaminación de la Microcuenca Sangoyaco por la conexión directa de vertimientos de aguas residuales al rio, además del depósito diario de gran cantidad de residuos sólidos de diferente composición como desperdicios de alimentos, desechos de animales, detergentes, entre otros.
Por lo anterior se pretende realizar una Caracterización fisicoquímica, microbiológica y macrobiologica de las aguas del afluente en todo su trayecto y en diferentes condiciones climatológicas, que permitan conocer el grado de impacto sobre sus recursos y las problemáticas por la modificación de sus ecosistemas; a este aspecto se le suma la escaza información e investigación realizada sobre este cuerpo hídrico.